DeepCalici & DeepCalici Plus

DeepCalici

DeepCalici는 단백질과 리간드 사이의 결합 친화도를 마이크로몰(µM) 단위로 예측하기 위해 4차원 합성곱 신경망(4DCNN) AI 모델을 사용하는 모듈로 후속 실험 계획을 간소화합니다.
선행 모듈: AI-Dock 또는 AI-Dock Plus

DeepCalici Plus

DeepCalici Plus는 DeepCalici의 향상된 버전입니다.
기존 DeepCalici 모듈보다 정확한 예측, 더 효율적인 GPU 메모리 사용, 그리고 더 빠른 성능을 제공합니다.
선행 모듈: AI-Dock 또는 AI-Dock Plus

실행화면

AI 예측을 위한 리간드 화합물 선택합니다.

리간드 화합물이 많을 경우 범위를 지정할 수 있습니다.

DeepCalici/DeepCalici Plus 모듈이 완료되면 예측된 결합 친화도(µM) 값이 오름차순으로 정렬됩니다.

결과화면

결과 화면에서 결합 친화도(Binding Affinity)값을 기준으로 정렬을 오름차순, 내림차순으로 변경할 수 있습니다.

완료 후, 사용자는 다운로드 버튼을 눌러 모든 결과를 다운로드하여 추가 분석을 할 수 있습니다.
다운로드 폴더에는 다음 파일이 포함되어 있습니다:
- Dock_ligand_pdbqt: 타겟 단백질과 결합 상태의 리간드 입체 구조
- Org_ligand_pdbqt: 타겟 단백질과 결합하기 전의 원래 리간드
- Protein_pdbqt: 도킹을 위한 단백질 파일 및 관련 파일
- Results: 선택된 리간드의 결합 에너지, 결합 친화도 및 SMILES가 포함된 엑셀 파일