Peptide Dock
Peptide Dock 可执行肽–蛋白质对接模拟, 用于预测肽配体在目标蛋白活性位点处的结合构象 (Binding Pose) 及分子相互作用。
前置模块
- PDB File Upload
- PDB Code Input
- Peptide Upload
- Peptide Sequence Upload
- PocketFinder
- Peptide Dock
- Peptide Design
输入数据
选择连接模块
如果您已有肽序列，请使用 Peptide Sequence Upload 模块。
指定活性位点
指定目标蛋白的活性位点。
如果您在上一步中使用 PocketFinder 查找了活性位点, 系统将自动填写相应的坐标。
❗PocketFinder 是一款针对小分子（Small Molecule）结合位点识别进行优化的模块。因此，它可能无法始终准确预测肽的结合位点。运行 Peptide Dock 前，请确认预测的活性位点是否适合肽结合。建议手动指定活性位点后再进行分析。
页面中将显示已上传的肽信息。
模块执行页面
进度信息
结果页面
