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⚠️ 当前Library Focus模块仅作为客户服务业务使用,未对全部用户开放。
如您需要使用改模块筛选配体库,请与我们联系。

  • 电话:+82 042-719-4319
  • 电子邮件:info@calici.co

Library Focus

Library Focus模块能够有效地对庞大的化合物库进行大规模筛选。
运行Library Focus需要大量的代币,同时运行时间也会较长。

模块操作流程

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在基础操作流程(见《模块和基本操作流程》页面基本操作流程章节)的第4步对接阶段, 可以运行Library Focus模型作为替代。

可接受的输入模块:PocketFinder(推荐), AI-Dock, AI-Dock Plus
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将Library focus模块连接到已完成的PocketFinder模块后即可运行。
PocketFinder模块可用AI-dock、AI-dock Plus模块代替。

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然后请选择Run按钮。

参数

结合“口袋”确认

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再次确认PocketFinder提供的结合点位信息,必要时修改结合点位及范围(统称结合“口袋”)。

设置配体库和置信度

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请选择您想要筛选的配体库和置信度。
置信度越高,每个采样组的采样数越多,但操作时间和成本也相应增加。
💡详细信息请参考:https://ko.surveymonkey.com/mp/sample-size-calculator/

运行画面

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Library Focus模块进行筛选。
结果按结合亲和度顺序排序。

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选择Result按钮确认结果。

结果画面

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① 结果配体表
② 整体热图(heatmap)

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模块处理后续使用

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随后可以使用多种模块来修改或检查经Library Focus筛选过的上游化合物。

  • 通过ChemEdit可以改变化合物的结构。
  • 通过InteractionViewer可以查看化合物和蛋白质之间的相互作用。
  • 通过ADME-Tox可以预测化合物的药代动力学和毒理学属性。