InteractionViewer
InteractionViewer是为详细了解蛋白质与配体的相互作用而设计的模块。
该模块允许可视化不同种类的蛋白质-配体复合物,包括AI预测的ESP表面。
可接受的输入模块:AI-Dock, AI-Dock Plus, DeepCalici, DeepCalici Plus
如下图所示,将InteractionViewer模块连接到完成的AI-Dock Plus模块后面即可运行。
当然,AI-Dock Plus模块可替换为AI-dock、DeepCalici、DeepCalici-Plus模块。

然后请选择Run按钮。
运行画面
模块运行准备

请选择想要更详细地查看与蛋白质相互作用的配体。
进度信息

模块处理各种信息,包括ESP表面。
실행 완료

选择Result按钮确认结果。
结果画面
查看复合物

① 切换全屏/非全屏显示
② 切换背景颜色(黑/白)
③ 开始/停止分子结构360°展示
④ 开始/停止分子结构左右摇摆
⑤ 将分子自动缩放至合适大小并置于屏幕正中央
⑥ 截图

通过这个按钮,您可以选择各种复合展示选项
- Orthographic(正交):简化表示,将立体结构投影到平面上。 所有线条都平行投影。
- Perspective(远近):这是一种更真实的展示方式。通过透视效果,使远处的物体看起来比附近的物体小,满足近大远小的客观物理规律。
- Stereo(立体):生成两个3D图像,通过左眼和右眼观察时产生立体效果。

可以选择不同方式的蛋白质显示方式(允许重复)。

选择想要更详细查看的配体。
详细描述了与蛋白质结合点位相互作用的配体。

① 要查看交互的详细信息,请把鼠标向上拖动。
② 选择想要查看的相互作用类型。