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InteractionViewer

InteractionViewer是为详细了解蛋白质与配体的相互作用而设计的模块。
该模块允许可视化不同种类的蛋白质-配体复合物,包括AI预测的ESP表面。

可接受的输入模块:AI-Dock, AI-Dock Plus, DeepCalici, DeepCalici Plus
Interactionviewer-1

如下图所示,将InteractionViewer模块连接到完成的AI-Dock Plus模块后面即可运行。
当然,AI-Dock Plus模块可替换为AI-dock、DeepCalici、DeepCalici-Plus模块。 Interactionviewer-2
然后请选择Run按钮。

运行画面

模块运行准备

Interactionviewer-3
请选择想要更详细地查看与蛋白质相互作用的配体。

进度信息

Interactionviewer-4
模块处理各种信息,包括ESP表面。

실행 완료

Interactionviewer-5
选择Result按钮确认结果。

结果画面

查看复合物

Interactionviewer-6
① 切换全屏/非全屏显示
② 切换背景颜色(黑/白)
③ 开始/停止分子结构360°展示
④ 开始/停止分子结构左右摇摆
⑤ 将分子自动缩放至合适大小并置于屏幕正中央
⑥ 截图

Interactionviewer-8
通过这个按钮,您可以选择各种复合展示选项

  • Orthographic(正交):简化表示,将立体结构投影到平面上。 所有线条都平行投影。
  • Perspective(远近):这是一种更真实的展示方式。通过透视效果,使远处的物体看起来比附近的物体小,满足近大远小的客观物理规律。
  • Stereo(立体):生成两个3D图像,通过左眼和右眼观察时产生立体效果。

Interactionviewer-9
可以选择不同方式的蛋白质显示方式(允许重复)。

Interactionviewer-10
选择想要更详细查看的配体。
详细描述了与蛋白质结合点位相互作用的配体。

Interactionviewer-11
① 要查看交互的详细信息,请把鼠标向上拖动。
② 选择想要查看的相互作用类型。