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DeepCalici & DeepCalici Plus

DeepCalici是利用四维卷积神经网络(4DCNN)人工智能模型以微摩尔(µM)为单位预测蛋白质与配体之间结合亲和力的模块,简化了后续的实验。

DeepCaliciPlus是DeepCalici的增强版。
比现有的DeepCalici模块提供更准确的预测、更有效的GPU内存使用以及更快的性能。

Deepcalici-1

可接受的输入模块:AI-Dock, AI-Dock Plus

Deepcalici-2

运行画面

选择配体化合物进行AI预测。
Deepcalici-3

当DeepCalici/DeepCaliciPlus模块完成时,预测的结合亲和力(µM)值按升序排列。
Deepcalici-4

结果画面

完成后,用户可以按下下载按钮下载所有结果进行进一步分析。 下载文件夹包含下列文件 :

  • Dock_ligand_pdbqt:与目标蛋白结合状态的配体立体结构
  • Org_ligand_pdbqt:与目标蛋白结合之前的原始配体立体结构
  • Protein_pdbqt:对接的蛋白质文件及相关文件
  • Results:包含选定配体的结合能、结合亲和力和SMILES的Excel文件
    Deepcalici-5