모듈과 캔버스 그리고 기본 파이프라인
모듈이란?
파마코-넷은 모듈이라는 작업 단위를 사용합니다.
각 모듈은 다른 기능을 가집니다.
캔버스란?
시뮬레이션 내부의 화면으로 모듈을 그래프 형태로 나타냅니다.
캔버스 내에서 모듈을 연결하고 실행할 수 있습니다.
캔버스 내의 단축키
캔버스 내에서 단축키를 사용할 수 있습니다.
Ctrl + Shift + e:
모듈 연결 방법
모든 모듈은 드래그 앤 드롭(Drag & Drop)을 기본으로 합니다.
원하시는 모듈을 오른쪽 모듈목록에서 선택하여 왼쪽 캔버스에 끌어다 놓습니다.
모듈 박스 양쪽에 있는 동그란 점을 이용하여 모듈과 모듈을 연결합니다.
동그란 점을 클릭하면 해당 모듈과 연결할 수 있는 모듈의 점이 표시됩니다.
파이프라인
- 원하시는 타겟 단백질 코드를 입력하시거나 단백질 파일을 가지고 계시다면 업로드합니다.
- 해당 단백질의 활성부위를 탐색합니다.
- 단백질과 스크리닝 할 리간드 라이브러리를 선택하거나 사용자 라이브러리를 업로드합니다.
- 스크리닝을 실행합니다.
- 결합 친화도를 예측합니다.
- 예측 후 단백질과 상위 후보물질의 상호작용을 분석하여 시각화 합니다.
- 후보물질들의 ADMET를 예측할 수 있습니다.
- 후보물질들의 화학적 구조를 최적화 하고 최적화 된 후보물질을 다시 스크리닝, 결합 친화도 예측의 개선을 확인할 수 있습니다.
파마코-넷에서의 파이프라인
