InteractionViewer

InteractionViewer는 단백질과 리간드의 상호작용을 상세히 살펴보기 위해 고안된 모듈입니다.
이 모듈로 AI가 예측한 ESP 표면을 비롯한 다양한 종류의 단백질-리간드 복합체의 시각화를 확인할 수 있습니다.
선행 모듈: AI-Dock, AI-Dock Plus, DeepCalici, DeepCalici Plus

InteractionViewer 모듈을 완료된 AI-Dock Plus 모듈 뒤에 연결합니다.
AI-Dock Plus 모듈은 AI-dock, DeepCalici, DeepCalici-Plus 모듈로 대체 가능합니다.

그 다음 'Run' 버튼을 선택해주세요.

실행화면

모듈 실행 준비

단백질과의 상호작용을 더 자세히 보고 싶은 리간드들을 선택해주세요.

진행상황 메시지

모듈이 ESP 표면을 비롯한 다양한 정보를 처리합니다.

실행 완료

'Result' 버튼을 선택하여 결과를 확인합니다.

결과화면

복합체 살펴보기

① 전체화면 토글
② 스크린샷 저장
③ 분자 위치를 화면 중앙으로

다양한 복합체 디스플레이 옵션을 선택할 수 있습니다.
① No Spin : 회전을 멈춤
② Rock : 세로축을 기준으로 일정 각도 반복 회전
③ Spin : 세로축을 기준으로 360도 회전

다양한 복합체 디스플레이 옵션을 선택할 수 있습니다.
① Orthographic (직교) : 단순화한 표현, 입체 구조를 평면에 투영합니다. 모든 선이 평행하게 투영됩니다.
② Perspective (원근) : 보다 사실적인 표현, 원근 효과를 통해 먼 객체가 작게 보입니다.
③ Stereo (입체) : 이미지를 두 쌍 생성하여, 왼쪽과 오른쪽 눈을 통해 관찰 시 입체적인 효과를 만듭니다.
(출력물에 주로 사용되는 패시브 스테레오 방식입니다.)

다양한 방식의 단백질 표현 방법을 선택할 수 있습니다. (중복 허용)

더 자세히 살펴보고 싶은 리간드를 선택합니다.
단백질의 포켓 부분과 상호작용 하는 리간드가 상세히 표현됩니다.

① 상호작용의 상세정보를 보려면, 마우스를 위에 올리세요.
② 표현되길 원하는 타입의 상호작용을 왼쪽 옵션 창에서 선택하세요.