DeepCalici & DeepCalici Plus

DeepCalici는 단백질과 리간드 사이의 결합 친화도를 마이크로몰(µM) 단위로 예측하기 위해 4차원 합성곱 신경망(4DCNN) AI 모델을 사용하는 모듈로, 후속 실험 계획을 간소화합니다.

DeepCalici Plus는 DeepCalici의 향상된 버전입니다.
기존 DeepCalici 모듈보다 정확한 예측, 더 효율적인 GPU 메모리 사용, 그리고 더 빠른 성능을 제공합니다.

선행 모듈: AI-Dock, AI-Dock Plus

실행화면

AI 예측을 위한 리간드 화합물 선택합니다.

DeepCalici/DeepCalici Plus 모듈이 완료되면 예측된 결합 친화도(µM) 값이 오름차순으로 정렬됩니다.

결과화면

결과 화면에서 결합 친화도(Binding Affinity)값을 기준으로 정렬을 오름차순, 내림차순으로 변경할 수 있습니다.

완료 후, 사용자는 다운로드 버튼을 눌러 모든 결과를 다운로드하여 추가 분석을 할 수 있습니다.
다운로드 폴더에는 다음 파일이 포함되어 있습니다:
- Dock_ligand_pdbqt: 타겟 단백질과 결합 상태의 리간드 입체 구조
- Org_ligand_pdbqt: 타겟 단백질과 결합하기 전의 원래 리간드
- Protein_pdbqt: 도킹을 위한 단백질 파일 및 관련 파일
- Results: 선택된 리간드의 결합 에너지, 결합 친화도 및 SMILES가 포함된 엑셀 파일