ChemEdit

ChemEdit 모듈은 사용자가 선도 화합물의 화학적 구조를 직접 수정 및 최적화하는 모듈입니다.
이 모듈로 이전 결과의 화합물들의 구조를 수정한 뒤
다시 AI-Dock Plus 모듈을 통해 도킹하여 더 개선된 결과물을 확인할 수 있습니다.
선행 모듈: AI-Dock, AI-Dock Plus, DeepCalici, DeepCalici Plus

모듈 실행 파이프라인

ChemEdit 모듈을 완료된 AI-Dock Plus 모듈 뒤에 연결합니다.
AI-Dock Plus 모듈은 AI-dock, DeepCalici, DeepCalici-Plus 모듈로 대체 가능합니다.

'Run' 버튼을 선택해주세요.

실행화면

구조를 수정하고자 하는 화합물을 선택하거나, 새로운 화합물을 생성합니다.

화합물 수정

① ⚠️ 전체 삭제
② 저장된 구조 파일 열기
③ 구조 파일로 저장하기
④ 선택된 구조 복사
⑤ 클립보드 구조 붙여넣기
⑥ 선택된 구조 잘라내기
⑦ 되돌리기
⑧ 다시 실행
⑨ 방향족화
⑩ 방향족 제거
⑪ 구조 최적화
⑫ 명시적 수소 출력 토글
⑬ 확대 배율 변경

① 화면 이동
② 선택 / 선택된 부분 이동
③ 구조 삭제
④ 결합 그리기
⑤ 체인 그리기
⑥ 입체화학 속성 변경
⑦ 전하량 증가
⑧ 전하량 감소
⑨ S-그룹 속성 변경
⑩ R-그룹 레이블링
⑪ ‘+’ 연산자 추가
⑫ 화살표 그리기
⑬ 반응 매핑 툴
⑭ 타원/직사각형/직선 그리기
⑯ 이미지 추가

① 수소 원소 선택
② 탄소 원소 선택
③ 질소 원소 선택
④ 산소 원소 선택
⑤ 황 원소 선택
⑥ 인 원소 선택
⑦ 플루오린 원소 선택
⑧ 염소 원소 선택
⑨ 브로민 원소 선택
⑩ 아이오딘 원소 선택
⑪ 원소주기율표에서 선택
⑫ Any Atom 선택
⑬ 기타 확장 테이블

① 벤젠 구조 삽입
② 사이클로펜타아이엔 구조 삽입
③ 사이클로헥세인 구조 삽입
④ 사이클로펜테인 구조 삽입
⑤ 사이클로프로페인 구조 삽입
⑥ 사이클로뷰테인 구조 삽입
⑦ 사이클로헵테인 구조 삽입
⑧ 사이클로옥테인 구조 삽입
⑨ 프리셋에서 삽입할 구조 선택

① 원소 선택
② 원소를 삽입할 위치의 빈 화면 클릭
③ 결합 툴 선택
④ 삽입한 원소와 기존 구조를 드래그하여 연결
⑤ 구조 최적화

<결과화면>

① 원소 선택
② 원소를 수정할 위치의 원자 클릭
<결과화면>

① 변경할 결합 종류 선택
② 수정할 위치의 결합 클릭

<결과화면>

화합물 수정 후 저장

모듈이 자동으로 오류를 수정하고 3D 구조를 생성합니다.

결과화면

'Result' 버튼을 선택하여 결과를 확인합니다.

모듈 처리 이후 사용

완료된 ChemEdit 모듈은 Ligand Library, 또는 Ligand Upload와 같은 용도로 사용할 수 있습니다.
⭐ AI-Dock 모듈이 완료된 이후에 DeepCalici Plus, ADME-Tox, InteractionViewer 등 다양한 모듈을 이어 사용할 수 있습니다.